2000年以前，由于中药肉苁蓉资源枯竭，产品开发和产业化一直处于低谷，100多种以肉苁蓉为处方药的中成药基本停产或半停产。随着肉苁蓉种植栽培技术的成熟和大面积推广的成功，特别是肉苁蓉的药用价值和保健功能逐渐被认识，从召开首届肉苁蓉学术研讨会以来，我国出现了一大批专业从事肉苁蓉栽培和产业发展的企业，如西域苁蓉；同时，一批以中药肉苁蓉为处方药味的产品也开始涌现。

据不完全统计，肉苁蓉中药材的年销售额约为4.5亿元，肉苁蓉饮片的年销售额约为6.5亿元，与之相关的中成药年销售额约为55亿元，相关健康产品的年销售额约为140亿元。因此，目前中药肉苁蓉产业的总体规模约为206亿元，产业已初具规模。

肉苁蓉提取物的应用也进一步推动了肉苁蓉产业的发展，苯乙醇苷类成分为肉苁蓉属植物的主要成分，如松果菊苷在管花肉苁蓉提取物部分样品中的质量分数高达40%，毛蕊花糖苷质量分数高达10%。

通过对荒漠肉苁蓉和管花肉苁蓉提取物的全成分分析，结果表明，荒漠肉苁蓉寡糖类、甘露醇和甜菜碱含量较高；管花肉苁蓉苯乙醇苷类成分含量较高，寡糖类成分含量相对较低，且不含甜菜碱。结合其药效学研究结果发现，荒漠肉苁蓉在润肠通便方面作用较强，管花肉苁蓉在补肾、益精、抗衰老、抗阿尔茨海默病和帕金森病、保肝等方面效果更好，2种肉苁蓉各有特点，为临床精准使用提供参考。而肉苁蓉提取物在医药、保健品、药品、食品等方面的应用也很广泛。